Der Beruf des Pharmazeutisch-kaufmännischen Angestellten kann nur über das sogenannte "duale Ausbildungssystem" erworben werden. Dazu müssen sich die Interessenten eine Ausbildungsapotheke suchen. Nach Abschluss des Ausbildungsvertrages meldet der Apothekenleiter den PKA-Azubi in der zuständigen Berufsschule an.
Die Ausbildung behinhaltet Praxisphasen (= Ausbildung in der Apotheke) und Theoriephasen (= Ausbildung in der Berufsschule).
Der Bildungsgang wird in Sachsen-Anhalt aktuell als Landesfachklasse an den Berufsbildenden Schulen V geführt, was bedeutet, dass alle PKA-Auszubildenden aus Sachsen-Anhalt nach Halle fahren müssen.